Výpočet čisté mzdy vychází z hrubé mzdy, která je sjednaná mezi zaměstnavatelem a zaměstnancem buď v pracovní smlouvě, nebo ve mzdovém výměru.
Z hrubé mzdy zaměstnance je odvedeno 4,5 % na zdravotní pojištění a 7,1 % na sociální pojištění. Dále je odvedena záloha na daň, která se nejprve stanoví ve výši 15 %, popřípadě 23 % v případě mzdy, která přesahuje 3násobek průměrné hrubé mzdy, a to jako záloha před slevami. Následně, za předpokladu že zaměstnanec u zaměstnavatele podepsal prohlášení k dani pro uplatnění slev na dani a daňového zvýhodnění, se tato záloha před slevami sníží o slevy, popřípadě i o daňové zvýhodnění. V případě daňového zvýhodnění je možné dosáhnout daňového bonusu.
Čistá mzda se tedy spočítá tak, že se od hrubé mzdy odečte výše uvedené sociální a zdravotní pojištění a také záloha na daň po slevách a daňovém zvýhodnění.
